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人类基因组 10% 由逆转录病毒基因组成的原因已经找到

,醫學編輯
最近審查:01.07.2025
已發表: 2012-04-27 08:38

病毒学家已经发现了一种机制,可以让逆转录病毒作为哺乳动物 DNA 的一部分有效复制数百万年。

病毒的主要任务被认为是将自身的基因传递给后代。为了不惜一切代价进行繁殖,所有病毒都与包括人类在内的其他生物体并无二致。

病毒与人类的区别在于其结构极其简单,只有一个分子——基因组、病毒RNA、DNA,或在某些情况下,是它们的组合。病毒的另一个区别在于其双重状态——病毒颗粒或病毒粒子在细胞外处于“死亡”状态,几乎没有任何独立活动;病毒进入宿主细胞后处于“存活”状态,并开始增殖,融入细胞的DNA转录机制。

但是,随着内源性逆转录病毒的发现,最近发现某些病毒可能没有病毒体阶段。

这些病毒会将自己的基因传递给后代,而不会超出细胞范围(因此得名 - 内源性,换句话说是基因内的),并且它们的遗传程序内置于细胞 DNA 中,被认为是宿主基因组的组成部分。

现在已经确定,人类基因组中约有 8-10% 由数千万年前感染我们进化祖先的逆转录病毒的核苷酸序列组成。

也就是说,人类DNA的十分之一是由几百万年前的逆转录病毒基因组成的(“逆转”是指这些病毒利用逆转录机制复制自己的基因组:首先,病毒逆转录酶开始在病毒RNA上合成一条DNA链,然后在这条链上合成第二条链,然后这条病毒DNA穿透细胞核膜,进入宿主细胞,作为宿主细胞合成病毒RNA的基质)。

牛津研究所的研究人员与阿拉诺戴蒙德艾滋病研究中心(美国纽约)和雷加研究所(比利时)一起,决定找出古代逆转录病毒能够大量登记在我们基因中的机制。

为此,他们研究了38种哺乳动物的基因组。从这些基因组中,他们分离出含有逆转录病毒核苷酸序列的区域,然后通过计算机模拟(in-silico,换句话说,使用专门的计算机数学方法)比较这些区域之间的相似性、差异性以及它们在病毒DNA区域中所占的比例。

分析显示,某一类内源性逆转录病毒在其进化的某个阶段失去了 env 基因,该基因负责帮助病毒穿透细胞的蛋白质。

失去感染其他细胞的能力并不意味着失去自我复制的能力,只是现在病毒的整个生命周期开始在病毒移动 DNA 片段——逆转录转座子的帮助下与自身生命周期平行在宿主细胞内度过。

尽管最有趣的是,随着某些逆转录病毒失去传染功能,这些病毒在基因组中的代表性却迅速增加,其结果是病毒遗传物质在哺乳动物的DNA中占据主导地位。

通过比较不同的基因组,研究人员总结了这种现象的多样性:传染性的丧失导致病毒物质的数量增加了 30 倍。

内源性逆转录病毒对健康有害吗?

病毒完美地完成了自身基因传播的任务,它们作为乘客登记在人类DNA中,而不会对运输造成损害。对于宿主而言,它们在大多数情况下是无致病性、无传染性的,不会形成病毒颗粒,换句话说,不会感染任何人,并且处于细胞DNA转录的调控之下。

从另一个角度来看,有证据表明某些内源性逆转录病毒(例如一些导致劳斯肉瘤、淋巴瘤和脊髓病的外源性逆转录病毒)具有致癌潜力,并且很有可能刺激癌症的发展,尽管究竟是什么触发了迫使身体承担此类风险的过程尚不清楚。对我们基因组中“化石”病毒的研究才刚刚开始,因此,那些迫使我们从完全不同的角度审视自身身体的、最富启发性的发现仍在前方。


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