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沙眼衣原体通常不存在于泌尿生殖器官的物质中。
该方法基于使用 ELISA 方法检测尿道、宫颈管和结膜刮取物中的沙眼衣原体抗原，并通过目测评估结果（敏感性超过 79%，特异性超过 95%）。该方法基于衣原体中存在属特异性脂多糖抗原。该方法可以快速筛查病原体，但最终诊断需使用荧光抗体法或 PCR 进行。研究结果以阳性或阴性表示。为了获得满意的研究结果，必须遵循以下规则：必须正确取样（刮取物）并及时（2 小时内）送至实验室。
泌尿生殖道衣原体的快速诊断用于治疗尿道炎、前列腺炎、宫颈炎和附件炎。
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该方法的原理是使用荧光异硫氰酸酯标记的单克隆抗体，该抗体针对衣原体外膜的主要蛋白质，该蛋白质存在于所有沙眼衣原体血清型以及原体和网状体中。该方法的灵敏度可达90-95%，使用单克隆抗体可确保高特异性——在出现泌尿生殖道衣原体临床表现的情况下，特异性可达95%以上。
检查结膜刮片时，荧光抗体法的敏感性为70-95％，特异性为98％。
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