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肛裂的诊断并不困难。既往病史和特征性症状可提示其存在。肛门检查可明确诊断。展开臀部时，可在外缘发现肛裂或哨兵结节。如果检查时未发现肛裂，则应进行仔细的直肠指检。在这种情况下，可确定受影响的肛管壁是否密封。由于急性期疼痛剧烈和括约肌痉挛，不应进行直肠乙状结肠镜检查。如果需要将肛裂与其他疾病区分开来，可在肛裂下注射4-5毫升1%奴佛卡因溶液后进行检查。
肛裂的鉴别诊断包括尾骨痛、肛门型克罗恩病、非特异性溃疡性结肠炎。
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